2009年，福州馬尾－馬祖的“兩馬”海上客運(yùn)航線客流、船舶來往的增幅再創(chuàng)歷史新高，客流量逼近10萬人次，這也是福建沿海地區(qū)對臺“小三通”各條航線中客流增幅較大的航線。

　　據(jù)福州海關(guān)最新統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示，福州海關(guān)所屬的馬尾海關(guān)全年共監(jiān)管“兩馬”航線進(jìn)出境人員99243人次，其中進(jìn)境人員47710人次，出境人員51533人次，分別比上年同期增長30．46％、28．81％、32．03％，這是“兩馬”直航2001年初開航以來全年進(jìn)出人數(shù)最多的年份。

　　“兩馬”航線船舶往來比上年同期增長2．4％，馬尾海關(guān)共監(jiān)管進(jìn)出境船舶1452艘次。

　　據(jù)統(tǒng)計，截至2009年底，廈門－金門、馬尾－馬祖、泉州－金門等福建沿海對臺“小三通”各條海上客運(yùn)航線客運(yùn)總量突破500萬人次。